Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAPAQ9P0L0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms