Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKIRAS1Q9NYS0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms