Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RDH8Q9NYR8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms