Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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