Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDAP2Q9NXN4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms