Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC25Q9NXE8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms