Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF3Q9NUQ8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF3Q9NUQ8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms