Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRKQ9NRH2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms