Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms