Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AKIP1Q9NQ31 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AKIP1Q9NQ31 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms