Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms