Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-5Q9HDB9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms