Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms