Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP62CLQ9H1M0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms