Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF3BQ9BZI7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms