Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP3-1Q9BYR8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP3-1Q9BYR8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms