Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP4AQ9BY43 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms