Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF4Q9BUZ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms