Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms