Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG101Q9BSB4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG101Q9BSB4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms