Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms