Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIN2AQ99865 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIN2AQ99865 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms