Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYCBPQ99417 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms