Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3IPQ96QF0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3IPQ96QF0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms