Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms