Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT3

GUCD1, Protein GUCD1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1Q96NT3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GUCD1Q96NT3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GUCD1Q96NT3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms