Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFXN2Q96NB2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFXN2Q96NB2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms