Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC1Q96MU7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms