Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms