Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC74BQ96LY2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms