Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM47Q96LD4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms