Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP400Q96L91 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms