Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00208Q96KT6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms