Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms