Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS50Q96JG6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms