Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC10A4Q96EP9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC10A4Q96EP9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms