Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELP4Q96EB1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms