Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms