Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TOPBP1Q92547 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms