Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB4Q8WW32 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB4Q8WW32 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms