Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC2Q8TF17 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms