Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms