Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms