Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPUSD2Q8IZ73 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms