Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPAP2Q8IXW5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms