Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms