Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRX1Q86UT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRX1Q86UT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms