Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q71RC1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q71RC1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q71RC1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q71RC1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q71RC1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms