Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN12Q6ZSI9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms