Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HACD2Q6Y1H2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms